Как рассчитать перелет в командировке если на выходные дни пришлось 31 час фактического времени перелета (в обе стороны)

Здравствуйте, Марат

Согласно Постановлению Правительства РФ от 13.10.2008 N 749 "Об особенностях направления работников в служебные командировки" (вместе с "Положением об особенностях направления работников в служебные командировки") днем выезда в командировку считается дата отправления поезда, самолета, автобуса или другого транспортного средства от места постоянной работы командированного, а днем приезда из командировки - дата прибытия указанного транспортного средства в место постоянной работы. При отправлении транспортного средства до 24 часов включительно днем отъезда в командировку считаются текущие сутки, а с 00 часов и позднее - последующие сутки.В случае если станция, пристань или аэропорт находятся за чертой населенного пункта, учитывается время, необходимое для проезда до станции, пристани или аэропорта. Аналогично определяется день приезда работника в место постоянной работы. Вопрос о явке работника на работу в день выезда в командировку и в день приезда из командировки решается по договоренности с работодателем. Оплата труда работника в случае привлечения его к работе в выходные или нерабочие праздничные дни производится в соответствии с трудовым законодательством Российской Федерации.

То есть,  по смыслу Положения, 31 час Вам обязаны оплатить в повышенном размере.

Тем не менее,  в ТК РФ эта ситуация  не урегулирована, поэтому нужно смотреть  локальный нормативный акт о командировках Вашей организации, который обязан быть согласно ч.  4 ст.  168 ТК РФ.