Увольнение с двухнедельной отработкой

После подписания заявления на увольнение директором, продолжил работать, а заявление оставил на руках. Донес информацию до своего непосредственного начальница что получил отработку до 12 октября. 10 октября открыл больничный лист, закрыл 16 октября. 17 октября, утром, приехал отдать больничный лист и произвести расчет. Мне отказали, так как я должен был отдать это заявление в отдел кадров. В итоге заново нужно оформлять заявление от сегодняшней даты и возможно снова получу отработку. Можно ли как то избежать этого, если я не знал что нужно было отдать заявление сразу и мне не объяснили это?