Кто выпускает приказ об увольнении по предельному возрасту?

Здравствуйте, Эдуард

Решение об увольнении военнослужащего-контрактника по достижении предельного возраста (56 лет) принимает командир воинской части, а не Министерство обороны.

Это следует из:
Статьи 34 пункта 8 Положения о порядке прохождения военной службы, утвержденного Указом Президента РФ от 16.09.1999 № 1237, которая устанавливает, что увольнение военнослужащих с военной службы производится:
военнослужащих, имеющих воинские звания до полковников, капитанов 1 ранга включительно, - должностными лицами, имеющими право назначения на воинские должности, которые эти военнослужащие занимают.

Пункта 26 Порядка деятельности должностных лиц и органов военного управления по организации прохождения военной службы по контракту в Вооруженных Силах Российской Федерации (Приложение № 1 к приказу Министра обороны РФ от 30.10.2015 № 660), который определяет, что представление военнослужащего к увольнению с военной службы подготавливается командиром (начальником) воинской части.

Пункта 8 того же Порядка, который устанавливает, что на основании выписки из решения командир (начальник) воинской части заключает с военнослужащим новый контракт или представляет его к увольнению с военной службы.

Таким образом, если военнослужащий не является высшим офицером, решение о его увольнении по достижении предельного возраста должен принимать командир воинской части, а не Министерство обороны. Соответственно, приказ об увольнении в этом случае должен издавать командир воинской части, а не министр обороны.