Налогооблажение МФО

Здравствуйте, Амир

какими налогами организация облагается?

На общей системе налогообложения (ОСН) организации и ИП платят "классические" налоги: организации - НДС и налог на прибыль, предприниматели - НДС и НДФЛ с предпринимательских доходов.
Если есть работники, то организации и ИП должны платить за них НДФЛ и страховые взносы. Кроме того, ИП платят еще страховые взносы за себя, даже если нет работников.
При ОСН, возможно, также придется платить другие налоги и сборы, например акцизы, налог на имущество, транспортный, земельный налоги, торговый сбор и другие - если есть соответствующие операции или объекты обложения.
Общую систему налогообложения организации и ИП применяют по умолчанию, если не заявят о выборе специального налогового режима.

При этом, у МФО имеются особенности в  исчислении и учете доходов и расходов при осуществлении деятельности по микрокредитованию. Такая деятельность, налогообложение, отчетность и раскрытие информации регламентированы специальными актами ЦБ, МинФин и т. д.

кто платит налог НДФЛ, заемщик или мфо?

НДФЛ - это налог на доходы физического лица. Заемщик при получении займа доход не получает - а значит и налога у него не возникает.