Как оплатить налоги и страховые взносы за 3 месяца?

Добрый день. Я зарегистрировала ООО в начале года на УСН 6%. Осуществлять свою деятельность организация начала только в апреле. Пока занимались предприятием, совсем забыли о ТК. У нас нет сотрудников, но само самой есть ген. директор, он же учредитель. Само собой з/п он не получает. Но я совсем забыла о том, что он как ни крути является сотрудником, должен получать з/п, и за него нужно платить НДФЛ и страховые взносы. Теперь я не знаю с какой стороны подойти и за что схватиться. Подскажите пожалуйста, как правильней выдать ему з/п за эти 3 месяца и перечислить все налоги и взносы, чтобы не вызвать вопросов? Я оформила с ним договор на неполный рабочий день, чтобы поставить минимальную з/п. Заранее спасибо за ответы)