Вы должны знать, что оформлять доплату можно по- разному.
Например, в порядке ст. 60.2 ТК РФ, согласно которой с письменного согласия работника ему может быть поручено выполнение в течение установленной продолжительности рабочего дня (смены) наряду с работой, определенной трудовым договором, дополнительной работы по другой или такой же профессии (должности) за дополнительную оплату.
В силу ст. 151 ТК РФ размер доплаты устанавливается по соглашению сторон трудового договора с учетом содержания и (или) объема дополнительной работы.
Оклад и зарплата это разные вещи. Согласно ст. 129 ТК РФ заработная плата (оплата труда работника) - вознаграждение за труд в зависимости от квалификации работника, сложности, количества, качества и условий выполняемой работы, а также компенсационные выплаты (доплаты и надбавки компенсационного характера, в том числе за работу в условиях, отклоняющихся от нормальных, работу в особых климатических условиях и на территориях, подвергшихся радиоактивному загрязнению, и иные выплаты компенсационного характера) и стимулирующие выплаты (доплаты и надбавки стимулирующего характера, премии и иные поощрительные выплаты)
По смыслу Определения Верховного Суда РФ от 11.03.2003 N КАС03-25 "Об отмене решения Верховного Суда РФ от 01.11.2002 и признании частично недействующими подпункта "а" (абзац 3) и абзаца 4 пункта 1 разъяснения Госкомтруда СССР N 30, ВЦСПС N 39 от 29.12.1965 "О порядке оплаты временного заместительства" следует, что согласно ст. 21 ТК РФ работник имеет право на выплату заработной платы в полном объеме в соответствии со своей квалификацией, сложностью труда, количеством и качеством выполненной работы. Таким образом, в случае выполнения работником дополнительной работы его трудовая функция изменяется в количественном и (или) качественном выражении, то есть объем выполняемой им работы так или иначе увеличивается, что предполагает соответственно увеличение оплаты труда.
Позиция судов на данный момент состоит в том, что с минимальным размером оплаты труда сравнивается вся месячная заработная плата работника с учетом стимулирующих и компенсационных выплат (смотрите, например, решение Верховного суда РФ от 24.12.2008 N ГКПИ08-2150, определения Верховного суда РФ от 10.09.2008 N 83- Г08-11 и от 03.08.2005 N 58- Г05-21, определение Конституционного суда от 01.10.2009 N 1160- О- О).
Однако, согласно ст. 149 ТК РФ к работе в условиях, отклоняющихся от нормальных относится и дополнительная работа, которую Вы выполняете.
Поэтому, если вместе с доплатой за эту работу Ваша зарплата составила не меньше МРОТ, то Вам и начислят МРОТ.
Вывод - доплата тоже входит в МРОТ, хотя, на мой взгляд, здесь явная дискриминация, которая запрещена трудовым законодательством
Статья 132. Оплата по труду
Заработная плата каждого работника зависит от его квалификации, сложности выполняемой работы, количества и качества затраченного труда и максимальным размером не ограничивается, за исключением случаев, предусмотренных настоящим Кодексом.
Запрещается какая бы то ни было дискриминация при установлении и изменении условий оплаты труда.
Учитывая тот факт, что официальные разъяснения по данному вопросу отсутствуют, а судебная практика по этому вопросу неоднозначна, я могу высказать только свое экспертное мнение, считая это дискриминацией в оплате труда.